More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_0428 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  100 
 
 
114 aa  235  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  100 
 
 
114 aa  235  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  43.86 
 
 
114 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  46.9 
 
 
114 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  46.9 
 
 
114 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  43.86 
 
 
114 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  34.29 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  36.84 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  47.54 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  30.86 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  29.82 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  44.07 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  32.1 
 
 
374 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  33.33 
 
 
374 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
380 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  42.68 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  30.86 
 
 
374 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  30.86 
 
 
374 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  42.37 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  30.86 
 
 
374 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  45.45 
 
 
200 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  26.26 
 
 
374 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  29.63 
 
 
374 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  29.63 
 
 
374 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  30 
 
 
358 aa  62  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  50.79 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
321 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  38.36 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  41.25 
 
 
293 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
262 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 
281 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  43.08 
 
 
262 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  25.88 
 
 
368 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  43.08 
 
 
262 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  44.07 
 
 
197 aa  58.2  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  42.59 
 
 
359 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  38.98 
 
 
194 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  39.29 
 
 
459 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  43.33 
 
 
262 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  28.12 
 
 
369 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  29.59 
 
 
364 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
152 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  46.97 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  35.34 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
189 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  43.55 
 
 
189 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 
361 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.79 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.79 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  31.43 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 
273 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
176 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 
100 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  44.64 
 
 
189 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 
235 aa  53.9  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  42.37 
 
 
259 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.97 
 
 
122 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  36.51 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  27.35 
 
 
211 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  38.98 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  33.33 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
192 aa  53.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  34.04 
 
 
197 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 
231 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 
206 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  35.59 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  37.5 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 
143 aa  52  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 
338 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 
370 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 
322 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  39.29 
 
 
362 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 
380 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  31.82 
 
 
210 aa  51.6  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 
277 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
204 aa  51.2  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
320 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 
334 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  32.11 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  35 
 
 
161 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  32.11 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>