225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3833 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  100 
 
 
114 aa  229  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  100 
 
 
114 aa  229  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  71.93 
 
 
114 aa  174  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  46.9 
 
 
114 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  46.9 
 
 
114 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  31.58 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  36.17 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 
205 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
321 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  32.94 
 
 
380 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.5 
 
 
481 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  29.91 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  35.63 
 
 
489 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  34.19 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  34.19 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  29.91 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 
211 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
490 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  35 
 
 
200 aa  55.1  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  28.57 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 
478 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  33.8 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 
490 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  33.85 
 
 
301 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 
137 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  25.71 
 
 
374 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  32.43 
 
 
358 aa  50.8  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
281 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  42.86 
 
 
200 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 
231 aa  50.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  37.29 
 
 
197 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 
176 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  47.92 
 
 
188 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  32.79 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2922  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
196 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 
268 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  28.28 
 
 
374 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  27.96 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  36.67 
 
 
258 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  30.14 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
117 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 
110 aa  47  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  30.14 
 
 
149 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 
141 aa  47.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 
100 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 
72 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  31.25 
 
 
489 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 
208 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.88 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  29.73 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.88 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  30.14 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  25.25 
 
 
242 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  25.29 
 
 
432 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  29.23 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  25.45 
 
 
133 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0873  DNA-binding protein, putative  30 
 
 
222 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  27.27 
 
 
374 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  29.51 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  26.19 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  26.19 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  30.67 
 
 
255 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  26.21 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  27.69 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  36.07 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  27.27 
 
 
374 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  27.27 
 
 
374 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  30.14 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  27.27 
 
 
374 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  29.73 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  24.49 
 
 
369 aa  45.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 
250 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  34.85 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0848952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>