153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2037 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 
358 aa  730    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  55.18 
 
 
359 aa  392  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  27.27 
 
 
374 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  26.23 
 
 
374 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  26.8 
 
 
374 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  26.8 
 
 
374 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  26.8 
 
 
374 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 
368 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  27.55 
 
 
374 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  27.75 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  26.52 
 
 
374 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 
380 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  26.37 
 
 
374 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  26.49 
 
 
369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  29.3 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  39.77 
 
 
208 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 
205 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  30 
 
 
114 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  30 
 
 
114 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
185 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  36.11 
 
 
262 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  36.11 
 
 
262 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 
262 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
268 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
262 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  35.14 
 
 
189 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  35.87 
 
 
186 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  38.33 
 
 
142 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 
194 aa  56.2  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  36.67 
 
 
146 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
176 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 
115 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 
115 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  36.67 
 
 
196 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 
137 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  36.67 
 
 
197 aa  54.7  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 
185 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
277 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  29.27 
 
 
361 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  44.23 
 
 
293 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 
189 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  44.23 
 
 
189 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  41.38 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  42.59 
 
 
459 aa  53.1  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 
364 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  39.34 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
134 aa  52.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  23.03 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  31.43 
 
 
200 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  30.19 
 
 
135 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  27.48 
 
 
192 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  31.15 
 
 
210 aa  51.6  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 
163 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
123 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.43 
 
 
114 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  32.43 
 
 
145 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  32.43 
 
 
114 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
85 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
273 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  30.91 
 
 
206 aa  50.4  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  44.68 
 
 
320 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 
107 aa  49.7  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
196 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
125 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 
142 aa  49.7  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 
395 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  29.76 
 
 
259 aa  49.7  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
281 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 
115 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  31.33 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  33.82 
 
 
296 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  36.54 
 
 
235 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  31.37 
 
 
123 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  33.9 
 
 
197 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  25.27 
 
 
118 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 
152 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 
197 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
139 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  35.38 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 
206 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  33.33 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
113 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  32.2 
 
 
143 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  33.77 
 
 
201 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 
178 aa  47.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 
200 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
474 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  27.27 
 
 
149 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  36.21 
 
 
108 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
364 aa  47  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 
104 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  36.21 
 
 
108 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 
191 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 
163 aa  46.6  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
203 aa  46.6  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
183 aa  46.6  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>