More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B4236 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  299  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  94.63 
 
 
149 aa  286  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  91.28 
 
 
149 aa  276  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  87.92 
 
 
149 aa  275  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  88.59 
 
 
149 aa  273  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  86.58 
 
 
149 aa  269  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  94.32 
 
 
92 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  51.82 
 
 
143 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0957  hypothetical protein  78.46 
 
 
66 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000983228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1192  dna-binding protein  78.18 
 
 
64 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000592004  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  50.77 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  29.32 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  50 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  45.12 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  46.05 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  31.79 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  44.3 
 
 
204 aa  72  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  47.56 
 
 
334 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 
312 aa  71.6  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  38.89 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  43.06 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 
197 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  34.75 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  41.67 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  43.24 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 
327 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  40.3 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  40.51 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  31.3 
 
 
262 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 
262 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  40.3 
 
 
262 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  34.01 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 
63 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  42.19 
 
 
189 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
189 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
320 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  31.93 
 
 
197 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  32.04 
 
 
395 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
273 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 
374 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  41.54 
 
 
362 aa  60.8  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  42.86 
 
 
296 aa  60.5  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 
224 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
380 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
63 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  35.23 
 
 
374 aa  57.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  37.68 
 
 
374 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 
178 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  35.16 
 
 
374 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  30.47 
 
 
185 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  40.62 
 
 
459 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  35.16 
 
 
374 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  35.16 
 
 
374 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  35.16 
 
 
374 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 
380 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 
368 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
361 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  36.92 
 
 
194 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
231 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 
242 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  36.11 
 
 
293 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  29.36 
 
 
369 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  36.23 
 
 
374 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  32.5 
 
 
210 aa  53.9  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
321 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 
210 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  46.15 
 
 
197 aa  53.9  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  34.29 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
110 aa  53.9  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  34.29 
 
 
108 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  41.94 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  46.3 
 
 
78 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  45.28 
 
 
436 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>