187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2097 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 361 aa  743    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  63.89 
 
 		 364 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  23.92 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  25.71 
 
 		 374 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  24.87 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  25.26 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  25.19 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  25.19 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  24.54 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  25.46 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  24.93 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  24.21 
 
 		 374 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 242 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  23.96 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  25.15 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 163 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  39.33 
 
 		 197 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  47.62 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 144 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 135 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  36.62 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  40 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  28.12 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  28.12 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  35.21 
 
 		 92 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 142 aa  55.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  38.98 
 
 		 149 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 149 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 137 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 149 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  35.21 
 
 		 149 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 358 aa  53.9  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 183 aa  53.1  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 145 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  38.16 
 
 		 244 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  41.27 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 175 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 83 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 206 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 67 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 142 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  40.98 
 
 		 194 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  40.35 
 
 		 67 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 197 aa  49.7  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 132 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 198 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 66 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 66 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  40.35 
 
 		 67 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 67 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.43 
 
 		 119 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 120 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  40.35 
 
 		 67 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  33.77 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 67 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 66 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  48.33 
 
 		 144 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 95 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  41.51 
 
 		 67 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 67 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 224 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  31.58 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  39.71 
 
 		 216 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  43.33 
 
 		 256 aa  47.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 106 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  38.71 
 
 		 194 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 192 aa  47.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 66 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  39.71 
 
 		 216 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4294  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 186 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 135 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  38.33 
 
 		 436 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 66 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  32.1 
 
 		 109 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 67 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 364 aa  46.6  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  31.58 
 
 		 262 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 99 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 69 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>