More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2965 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 71 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 64 aa  85.5  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  63.33 
 
 		 67 aa  84.7  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  60 
 
 		 78 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 77 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 63 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 65 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  58.33 
 
 		 68 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  55.93 
 
 		 62 aa  79  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 63 aa  79  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  53.03 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 70 aa  78.2  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 63 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 68 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 67 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  56.67 
 
 		 64 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 68 aa  75.5  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  58.33 
 
 		 64 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 67 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  56.45 
 
 		 69 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 70 aa  72.8  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 67 aa  72  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  53.23 
 
 		 69 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 68 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2281  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000223955  hitchhiker  0.000476001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 63 aa  67.8  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 72 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  39.17 
 
 		 859 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  39.17 
 
 		 822 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  45 
 
 		 73 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  39.17 
 
 		 822 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  39.17 
 
 		 823 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  39.17 
 
 		 824 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 65 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  39.17 
 
 		 843 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  34.72 
 
 		 846 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  39.17 
 
 		 821 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  39.17 
 
 		 825 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  39.17 
 
 		 824 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 68 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  39.17 
 
 		 825 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  41.27 
 
 		 64 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  47.69 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  47.69 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  47.69 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  39.17 
 
 		 841 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  47.69 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  39.17 
 
 		 842 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  39.17 
 
 		 855 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  47.69 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  47.69 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  39.17 
 
 		 842 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  39.17 
 
 		 843 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  39.17 
 
 		 855 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  47.69 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2214  Clp N terminal domain-containing protein  34.48 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2271  Clp N terminal domain-containing protein  34.48 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2225  Clp, N terminal  34.48 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.176488  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 79 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 64 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 65 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 73 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 73 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 65 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 79 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 69 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 67 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  36.29 
 
 		 818 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  45.31 
 
 		 67 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>