More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2033 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
65 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  55.56 
 
 
66 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  55.56 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  55.56 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  55.56 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  55.56 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  55.56 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  55.56 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  55.56 
 
 
70 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  63.93 
 
 
64 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0370  transcriptional regulator  60 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  55.56 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 
63 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  50.79 
 
 
64 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2151  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 
64 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.194811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 
65 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  48.33 
 
 
68 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  53.97 
 
 
74 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  49.21 
 
 
64 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  49.21 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 
68 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2913  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  48.33 
 
 
68 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  47.46 
 
 
62 aa  67.8  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0094  transcriptional regulator, XRE family  52.73 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
224 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0372  XRE family transcriptional regulator  57.38 
 
 
64 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0794944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  48.39 
 
 
377 aa  67  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 
70 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
77 aa  67  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  50.79 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  57.81 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  50.82 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 
72 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  49.21 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  49.21 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  49.18 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  49.21 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  49.21 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  49.21 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 
71 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  49.21 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  48.44 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  49.21 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 
63 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  48.44 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  51.67 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
71 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  54.1 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 
73 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  48.44 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 
72 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  55.74 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  55.74 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  55.74 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  55.74 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4867  DNA-binding protein  55.74 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  54.1 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  43.75 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2164  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  46.03 
 
 
377 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  50 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  50 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0505  DNA-binding protein  54.1 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  48.44 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  47.62 
 
 
80 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 
66 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0430  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  49.15 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1123  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  49.15 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0377  DNA-binding protein  54.1 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00278297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0368  PbsX family transcriptional regulator  54.1 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000574241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0365  PbsX family transcriptional regulator  54.1 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450823  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  51.67 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  49.15 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>