More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3360 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  100 
 
 		 67 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  95.45 
 
 		 66 aa  133  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  94.03 
 
 		 67 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  94.03 
 
 		 67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  92.54 
 
 		 67 aa  129  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  92.54 
 
 		 67 aa  129  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  92.54 
 
 		 67 aa  129  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  92.54 
 
 		 67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  91.04 
 
 		 67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  92.42 
 
 		 66 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  84.85 
 
 		 66 aa  121  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 66 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 66 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  75 
 
 		 66 aa  97.1  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  69.84 
 
 		 77 aa  97.1  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  70.31 
 
 		 69 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  69.35 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  60.61 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  66.13 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  68.25 
 
 		 65 aa  90.9  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 68 aa  89  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  59.09 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  59.09 
 
 		 69 aa  84  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  57.58 
 
 		 67 aa  83.6  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  51.56 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 71 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  56.67 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  56.67 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  56.67 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  52.31 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  56.67 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  56.67 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  56.67 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  56.67 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  57.89 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 64 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 63 aa  71.6  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  53.12 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  51.56 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  51.56 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  51.56 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  51.56 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  51.56 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  51.56 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  51.56 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  51.56 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  51.61 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  67  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  52.38 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  50 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  53.23 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  45 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  47.62 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 68 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  43.28 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  54.39 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  54.39 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  54.39 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  54.39 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  54.39 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 69 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  49.15 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  52.54 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  43.28 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  41.79 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  41.79 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  41.79 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  51.61 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>