More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0632 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 71 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  68.85 
 
 		 63 aa  98.6  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  67.16 
 
 		 69 aa  97.1  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 64 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  56.06 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  62.71 
 
 		 63 aa  83.2  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  56.45 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  55.56 
 
 		 67 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  56.45 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  56.45 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  56.45 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  56.45 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  56.45 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  56.45 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  56.45 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  57.38 
 
 		 64 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  57.38 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  55 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  52.24 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  56.67 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 72 aa  71.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  51.61 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  51.61 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  50.82 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  50 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2034  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  50 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  49.18 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  47.69 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4953  transcriptional regulator, DNA-binding protein  48.33 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4938  transcriptional regulator, DNA-binding protein  45.9 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  43.75 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5107  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5498  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  50.88 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  45 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1868  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.98 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  40.3 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  40.3 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  40.3 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>