More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2496 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
69 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  85.94 
 
 
64 aa  116  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  67.16 
 
 
71 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  64.06 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  64.52 
 
 
63 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  69.49 
 
 
63 aa  90.1  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  65 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  65 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  65 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  65 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  65 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  65 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  65 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  65 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  65 
 
 
67 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  63.33 
 
 
66 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 
64 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  58.46 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  59.02 
 
 
64 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  56.67 
 
 
65 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  56.67 
 
 
64 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  57.14 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  53.23 
 
 
67 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  53.23 
 
 
69 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  53.23 
 
 
69 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  52.46 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  51.61 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  51.61 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 
72 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  50.72 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  55.17 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  48.39 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  53.33 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4953  transcriptional regulator, DNA-binding protein  53.33 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4938  transcriptional regulator, DNA-binding protein  50.82 
 
 
63 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  49.18 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  46.77 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5107  DNA-binding protein  51.67 
 
 
63 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  46.77 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  46.77 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5498  DNA-binding protein  51.67 
 
 
63 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  46.77 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  50.85 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  44.93 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  50 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 
72 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  46.03 
 
 
68 aa  60.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  50.85 
 
 
377 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1868  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 
63 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2034  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  46.88 
 
 
376 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  45.9 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
63 aa  57.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  45.9 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  43.28 
 
 
67 aa  57  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  41.07 
 
 
72 aa  57  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  46.88 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  40.62 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  40.62 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  40.62 
 
 
101 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
63 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  46.88 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 
71 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
73 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  45.61 
 
 
377 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  42.37 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  41.67 
 
 
377 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 
68 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  40.32 
 
 
65 aa  53.9  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  43.86 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  47.37 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  41.18 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  47.37 
 
 
72 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  47.37 
 
 
72 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  47.37 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  39.71 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 
72 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  45.61 
 
 
69 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>