More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0251 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 
72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 
65 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  42.47 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
66 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
73 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  53.57 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  50 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  50 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  50 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  50 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  50 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  46.67 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  46.67 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 
73 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  45 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  46.67 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  50 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
77 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  48.28 
 
 
69 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  43.33 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  48.28 
 
 
69 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  48.28 
 
 
69 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  53.57 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  43.75 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  43.75 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  43.33 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  43.75 
 
 
101 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 
66 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  41.67 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  41.67 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  41.67 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
72 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  44.07 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 
72 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  48.33 
 
 
65 aa  60.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
69 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 
64 aa  60.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  47.06 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  47.06 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  47.06 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  47.06 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  47.06 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  42.19 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  47.06 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  47.06 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  41.67 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  47.06 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2164  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  42.19 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  43.08 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  44.83 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  42.19 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  42.19 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  42.19 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  42.19 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  47.06 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  42.19 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  42.19 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  41.54 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.62 
 
 
377 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1425  transciptional regulator  47.17 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.132768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  41.54 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  41.54 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  41.54 
 
 
72 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  42.86 
 
 
62 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  40.62 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
69 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  46.97 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  41.54 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  41.54 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  41.54 
 
 
72 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0094  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
70 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
67 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 
69 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  40 
 
 
72 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>