More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0533 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0142  transcriptional regulator, XRE family  81.43 
 
 		 91 aa  120  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0927186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3164  helix-turn-helix domain-containing protein  75.34 
 
 		 83 aa  120  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  72 
 
 		 80 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4304  transcriptional regulator, XRE family  72.22 
 
 		 80 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3389  XRE family transcriptional regulator  73.97 
 
 		 83 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14531  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7158  transcriptional regulator, XRE family  70.83 
 
 		 78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776523  normal  0.018417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2467  transcriptional regulator, XRE family  59.21 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  54.29 
 
 		 80 aa  84.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  56.16 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4879  XRE family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1855  XRE family transcriptional regulator  51.25 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1276  helix-turn-helix domain protein  53.62 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  55.17 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 63 aa  67.4  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  48.33 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  50 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  50 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  49.15 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 71 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  56.67 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  47.46 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  48.33 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  44.26 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  44.26 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0094  transcriptional regulator, XRE family  49.09 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  49.18 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  41.67 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  44.12 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  49.18 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2992  hypothetical protein  49.02 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.169879  hitchhiker  0.00733208 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  54.72 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  51.72 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 73 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  38.24 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>