More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4362 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 69 aa  133  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  49.25 
 
 		 377 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0821  XRE family transcriptional regulator  68.12 
 
 		 70 aa  70.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.323494  hitchhiker  0.000184498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  52.31 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  54.55 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  48.44 
 
 		 376 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  51.67 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  50 
 
 		 377 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  47.46 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  48.39 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3707  molybdate metabolism transcriptional regulator  50 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2913  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  45.76 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 73 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2034  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  43.08 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5107  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4938  transcriptional regulator, DNA-binding protein  44.07 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4953  transcriptional regulator, DNA-binding protein  44.07 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5498  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  38.81 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2239  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  45.16 
 
 		 368 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0377  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00278297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0368  PbsX family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000574241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.67 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0365  PbsX family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450823  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.67 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0370  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  38.81 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  35.94 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4867  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0505  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>