More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2370 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 72 aa  146  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 67 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  57.81 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  55.22 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  57.14 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 63 aa  70.5  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2913  transcriptional regulator, XRE family  54.1 
 
 		 79 aa  70.1  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  59.62 
 
 		 79 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  53.23 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  54.84 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  53.23 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  50 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  51.61 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  50 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  50 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 		 74 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  50 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  50 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  50 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  50 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  51.67 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  51.61 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  54.24 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  58.93 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  53.23 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  52.63 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  53.23 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  53.23 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  53.23 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0737  transcriptional regulator, XRE family  51.61 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  56.14 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  50.85 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  50.85 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  50.85 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  50.85 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  50.85 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  50.85 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  50.85 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  50.85 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  53.7 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  53.45 
 
 		 73 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  51.72 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  53.57 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  47.54 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  48.33 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  51.52 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  50 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>