More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1410 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 72 aa  147  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  64.62 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 74 aa  91.3  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 63 aa  89.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  59.38 
 
 		 72 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  58.06 
 
 		 69 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  60.94 
 
 		 69 aa  84.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 73 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 63 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  48.61 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  56.25 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 66 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  57.81 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 66 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 63 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 70 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  51.67 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 77 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 69 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 63 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 71 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  50 
 
 		 64 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  51.56 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  52.38 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  52.38 
 
 		 68 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 65 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 70 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  57.38 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  47.83 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 73 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  53.73 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  54.1 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  54.1 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  47.83 
 
 		 69 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  47.83 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1123  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  47.83 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  47.83 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  47.83 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  47.83 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  47.83 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  52.46 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  46.38 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  50 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  50.82 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  50.82 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  50.82 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  50.82 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  49.25 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  52.38 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  40 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  50.82 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  40 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  51.56 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  50 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>