More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1649 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 69 aa  142  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  79.69 
 
 		 72 aa  108  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  80.65 
 
 		 69 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  79.37 
 
 		 63 aa  105  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  73.85 
 
 		 67 aa  104  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  73.44 
 
 		 69 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  71.88 
 
 		 74 aa  98.6  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  61.9 
 
 		 69 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 72 aa  89  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  55.88 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 73 aa  84.7  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 63 aa  84  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 65 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  55.38 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 69 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  60 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  59.38 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  58.33 
 
 		 64 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 71 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  53.97 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  53.97 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  53.97 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  53.97 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  53.97 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  53.97 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  51.47 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  49.28 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  52.38 
 
 		 80 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1123  transcriptional regulator, XRE family  51.56 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  49.23 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  55 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  55 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  55 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  55 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  55 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  55 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  55 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  55 
 
 		 70 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  55.93 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  47.69 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 72 aa  70.1  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  50.77 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 63 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  55.36 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  53.33 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  51.67 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0430  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  51.67 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  54.24 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  50 
 
 		 67 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1932  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000103733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 68 aa  66.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  54.24 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2913  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  51.61 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>