More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0320 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
66 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  83.33 
 
 
66 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  80.3 
 
 
66 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  80.3 
 
 
66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  75.76 
 
 
77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  74.24 
 
 
68 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  75.38 
 
 
65 aa  103  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  72.73 
 
 
68 aa  101  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  74.19 
 
 
66 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  75.81 
 
 
67 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  72.58 
 
 
67 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  72.58 
 
 
66 aa  97.1  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  75 
 
 
67 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  66.67 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  70.97 
 
 
66 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  71.88 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  70.31 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  70.31 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  70.31 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  70.31 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  65.62 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  66.15 
 
 
70 aa  91.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  68.25 
 
 
69 aa  88.2  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  58.06 
 
 
67 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  58.06 
 
 
67 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  60.94 
 
 
66 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  56.45 
 
 
67 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  56.06 
 
 
72 aa  79.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 
67 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 
73 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 
68 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  52.31 
 
 
67 aa  70.9  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  48.48 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  48.48 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  48.48 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  48.48 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  50.77 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  48.48 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  48.48 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  48.48 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  52.31 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 
63 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 
69 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  46.97 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 
71 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  50.77 
 
 
72 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  51.67 
 
 
65 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  52.38 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  52.38 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  50 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 
69 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 
72 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 
73 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  43.94 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 
63 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 
70 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  48.33 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 
73 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  45.45 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  40.91 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  39.39 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  46.88 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0372  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0794944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  39.39 
 
 
73 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  45.31 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4867  DNA-binding protein  45.31 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  45.31 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  39.39 
 
 
73 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  45.31 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  39.39 
 
 
73 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  45.31 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2151  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.194811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  39.39 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  39.39 
 
 
73 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  39.39 
 
 
73 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  39.39 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  39.06 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  49.21 
 
 
64 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  46.55 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  41.94 
 
 
62 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  46.55 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  46.55 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  46.55 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  46.55 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  46.55 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
72 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  39.39 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>