More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2928 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 70 aa  146  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  63.08 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  66.15 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  63.08 
 
 		 68 aa  90.1  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  63.08 
 
 		 65 aa  90.1  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  67.19 
 
 		 68 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  66.13 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 66 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  61.9 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  61.9 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  60.32 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  60.32 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  62.9 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 66 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  62.9 
 
 		 66 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 66 aa  84  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 66 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  60.32 
 
 		 67 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  60.32 
 
 		 67 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  60.32 
 
 		 67 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  60.32 
 
 		 67 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  58.06 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  54.69 
 
 		 73 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  53.23 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  53.23 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  49.25 
 
 		 68 aa  70.1  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  54.84 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  49.23 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  43.08 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  53.45 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  49.28 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 224 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  49.21 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  43.08 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  42.65 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  47.54 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  45 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  40 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  43.28 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>