More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0195 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
65 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
65 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  58.73 
 
 
66 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  57.14 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  57.14 
 
 
67 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  57.14 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  57.14 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  57.14 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  57.14 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  57.14 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  57.14 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  59.68 
 
 
63 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  52.24 
 
 
71 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  59.38 
 
 
64 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  53.23 
 
 
66 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 
64 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  50.85 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  51.72 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  54.1 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  51.79 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  50 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  51.79 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
65 aa  62  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  50 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  50 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  48.21 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  45 
 
 
69 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
69 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  48.21 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  43.33 
 
 
69 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  48.21 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  48.21 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
63 aa  60.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  49.21 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1868  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  49.21 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
63 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  41.27 
 
 
78 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  53.19 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  40 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  46.67 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4713  transcriptional regulator  44.44 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0830303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4729  transcriptional regulator  44.44 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.693705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5148  hypothetical protein  44.44 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
72 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5112  hypothetical protein  44.44 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 
73 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  48.28 
 
 
72 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
69 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2034  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  40 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  45 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 
72 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  43.33 
 
 
377 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  46.55 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  46.55 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  46.55 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  48.33 
 
 
63 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
66 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  46.55 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
73 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5107  DNA-binding protein  46.67 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  35 
 
 
67 aa  55.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4953  transcriptional regulator, DNA-binding protein  46.67 
 
 
63 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282305  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  46.55 
 
 
72 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5498  DNA-binding protein  46.67 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  46.55 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  46.55 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>