More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1416 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4108  transcriptional regulator, XRE family  77.78 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  48.44 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  58.93 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2034  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  51.72 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  50.88 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  47.54 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  57.41 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  47.54 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  50.88 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  50.88 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  50.88 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  50.88 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  50.88 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  50.88 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  50.88 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  50 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 63 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  50.91 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  55.17 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 72 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  45.9 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0505  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0377  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00278297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0368  PbsX family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000574241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0365  PbsX family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450823  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  54.39 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  47.17 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4867  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  49.21 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  46.43 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0372  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0794944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  50.85 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  46.43 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  51.79 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  51.79 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  50 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  50 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  50 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  50 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  53.19 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  50 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  49.12 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  50 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  49.12 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  49.12 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  49.12 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  49.12 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>