More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2208 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 73 aa  152  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  72.06 
 
 		 71 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  70 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1932  XRE family transcriptional regulator  67.12 
 
 		 80 aa  100  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000103733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  69.12 
 
 		 70 aa  97.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1425  transciptional regulator  67.19 
 
 		 69 aa  94.4  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.132768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  65.28 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  67.61 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 72 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  60.61 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  57.14 
 
 		 64 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  50 
 
 		 69 aa  73.6  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  46.97 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  55.56 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  62 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 74 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  58 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  58 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  58 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  58 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  58 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  51.85 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  60.42 
 
 		 69 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  60.42 
 
 		 69 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  60.42 
 
 		 69 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  47.46 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  39.71 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  39.71 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  39.71 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  61.7 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  50.85 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  55.77 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2034  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  48.08 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  48.08 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  48.08 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  48.08 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5148  hypothetical protein  52.08 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  48.08 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  53.19 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  50.85 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  48.08 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  50 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  48.44 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  50 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  50.85 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  59.18 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4713  transcriptional regulator  52.08 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0830303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  50.85 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4729  transcriptional regulator  52.08 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.693705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5112  hypothetical protein  52.08 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  49.09 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  46.38 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  46.38 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  46.38 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  46.38 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  57.14 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>