More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2822 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 73 aa  150  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  84.93 
 
 		 77 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  76.39 
 
 		 72 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  82.61 
 
 		 79 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  72.86 
 
 		 71 aa  104  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  70 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  70.42 
 
 		 75 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1932  XRE family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 80 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000103733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1425  transciptional regulator  66.67 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.132768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 72 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  51.56 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  53.12 
 
 		 69 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  50.79 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 70 aa  67  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  52.24 
 
 		 68 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  53.03 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  50 
 
 		 62 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  50.82 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  54.1 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  52.54 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5148  hypothetical protein  45.45 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4713  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0830303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4729  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.693705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5112  hypothetical protein  45.45 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  50 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  42.42 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  44.26 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0372  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0794944  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1123  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0505  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0377  DNA-binding protein  43.48 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00278297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0368  PbsX family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000574241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0365  PbsX family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  50.88 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  53.19 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  44.26 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  50.77 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2034  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 64 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 64 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 64 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 64 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4867  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 64 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  48 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  48 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  48 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  48 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  48 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  48 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  48 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  48 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  48 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  43.55 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>