More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2218 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 68 aa  136  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 66 aa  101  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  67.16 
 
 		 68 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  70.77 
 
 		 65 aa  99.4  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  64.62 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  65.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 66 aa  90.9  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  68.25 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  63.08 
 
 		 70 aa  90.1  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  66.67 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  66.67 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  65.08 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  66.13 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  66.13 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  65.08 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  65.08 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  65.08 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  65.08 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  62.9 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  62.5 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 67 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  58.46 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  54.69 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  56.25 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  53.12 
 
 		 67 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 67 aa  77  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  53.97 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  53.03 
 
 		 68 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  49.23 
 
 		 69 aa  73.6  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  52.31 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 72 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  50.79 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  53.85 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  47.69 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 63 aa  71.6  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  53.03 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 80 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  54.39 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  50 
 
 		 62 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  50.77 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  50.77 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  50.77 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  49.23 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  45.9 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  48.44 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  46.27 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0370  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>