268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2034 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2034  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 96 aa  190  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  62.5 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  54.1 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  55.17 
 
 		 377 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  45.9 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  49.28 
 
 		 70 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  45.9 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  49.15 
 
 		 67 aa  62  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  50.85 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  53.45 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4108  transcriptional regulator, XRE family  71.11 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 73 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  45.16 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  45.76 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  38.67 
 
 		 377 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  43.1 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  48.28 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  43.1 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2151  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.194811  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1932  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000103733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  45.07 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1425  transciptional regulator  48.33 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.132768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  40 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>