More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3519 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 71 aa  146  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  71.01 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  72.86 
 
 		 73 aa  104  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  72.06 
 
 		 73 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1932  XRE family transcriptional regulator  73.02 
 
 		 80 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000103733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  63.77 
 
 		 79 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1425  transciptional regulator  62.5 
 
 		 69 aa  84.3  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.132768  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  62.12 
 
 		 75 aa  83.6  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 72 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  55.74 
 
 		 68 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  50.79 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  41.79 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.79 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  50.82 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  42.19 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  46.67 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  44.26 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0505  DNA-binding protein  40.91 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0377  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00278297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0368  PbsX family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000574241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0365  PbsX family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  50.85 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4867  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  48.33 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  49.06 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  47.06 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0372  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0794944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 69 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>