More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0752 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
69 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  65.62 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  61.9 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  61.9 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 
68 aa  79  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  55.88 
 
 
68 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  58.33 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  58.33 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  58.33 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  58.33 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  60.32 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  56.25 
 
 
68 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  58.33 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  58.33 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  58.33 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 
71 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  58.82 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  54.55 
 
 
68 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  56.67 
 
 
80 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  54.41 
 
 
68 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  52.31 
 
 
67 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  57.35 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 
65 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  52.17 
 
 
71 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  54.69 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 
72 aa  74.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  57.38 
 
 
64 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 
64 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  49.23 
 
 
67 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
69 aa  73.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0094  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  61.11 
 
 
65 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  53.62 
 
 
69 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
67 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  49.23 
 
 
67 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  51.56 
 
 
66 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  51.56 
 
 
66 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  55.38 
 
 
65 aa  72  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  55.74 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  51.56 
 
 
66 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  57.38 
 
 
64 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
67 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 
64 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  51.56 
 
 
69 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  51.56 
 
 
69 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  55.74 
 
 
63 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 
73 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 
63 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1123  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 
66 aa  70.5  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 
63 aa  69.7  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  50 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  51.56 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 
66 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  46.77 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  46.77 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  51.67 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  46.77 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  46.77 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  54.84 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  46.77 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  46.77 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  46.77 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 
63 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  46.77 
 
 
70 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
63 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  55 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  58.33 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 
65 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  46.77 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  46.88 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  46.88 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  46.88 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2281  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000223955  hitchhiker  0.000476001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  46.88 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4867  DNA-binding protein  46.88 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0737  transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  52.46 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 
63 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  51.61 
 
 
67 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  48.33 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  52.86 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  46.88 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  48.44 
 
 
69 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 
69 aa  67  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  48.44 
 
 
69 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  48.44 
 
 
69 aa  67  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
224 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
77 aa  67  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  46.88 
 
 
352 aa  67  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>