More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0692 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 74 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  77.94 
 
 		 69 aa  108  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  76.56 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 63 aa  100  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  68.12 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  73.02 
 
 		 63 aa  99  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  71.88 
 
 		 69 aa  98.6  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  70.31 
 
 		 73 aa  97.1  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  68.75 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 72 aa  91.3  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  59.42 
 
 		 69 aa  90.5  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  71.67 
 
 		 77 aa  90.1  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  62.69 
 
 		 70 aa  89.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 69 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  55.41 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  68.33 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1123  transcriptional regulator, XRE family  58.73 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  66.67 
 
 		 67 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 71 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  55.22 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  55.22 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  55.22 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  55.22 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  55.22 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  55.22 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  56.92 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 71 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  53.73 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  63.33 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 64 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 66 aa  78.2  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  55.88 
 
 		 68 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  54.69 
 
 		 68 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  58.33 
 
 		 65 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 63 aa  77  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  53.33 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 63 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  53.33 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  53.33 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  52.31 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 63 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0430  transcriptional regulator, XRE family  56.67 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  58.93 
 
 		 62 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 63 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 72 aa  72.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  57.38 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  57.38 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  57.38 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  57.38 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  57.38 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2164  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  57.38 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  57.38 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  57.38 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  53.33 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  53.33 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  55 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  51.56 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  55.74 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 71 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  53.12 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 71 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  53.12 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  50.82 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  53.12 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2913  transcriptional regulator, XRE family  56.67 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  53.97 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  53.12 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  53.12 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  52.46 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>