More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3368 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  100 
 
 
67 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  93.94 
 
 
66 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  92.54 
 
 
67 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  91.04 
 
 
67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  89.55 
 
 
67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  89.39 
 
 
66 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  88.06 
 
 
67 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  88.06 
 
 
67 aa  127  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  88.06 
 
 
67 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  88.06 
 
 
67 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  81.82 
 
 
66 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  79.03 
 
 
66 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  74.19 
 
 
66 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  75.81 
 
 
66 aa  99.4  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  77.42 
 
 
66 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  69.35 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  72.58 
 
 
68 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  67.74 
 
 
69 aa  94.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  63.64 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  66.13 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  70.97 
 
 
65 aa  92  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  68.25 
 
 
68 aa  90.9  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  62.12 
 
 
69 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  60.61 
 
 
67 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  60.61 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  59.09 
 
 
67 aa  84  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  60.32 
 
 
70 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  54.69 
 
 
73 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  57.38 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 
71 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  53.23 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  53.23 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  53.23 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  53.23 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  53.23 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  53.23 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  53.23 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  53.23 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  55.93 
 
 
65 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  57.38 
 
 
72 aa  73.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  56.14 
 
 
64 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 
69 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 
72 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
63 aa  70.1  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  52.46 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  50 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  51.61 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  48.44 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  48.44 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  48.44 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  48.44 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  48.44 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  48.44 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  48.44 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  51.61 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  48.44 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  46.67 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  51.61 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 
63 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 
63 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 
72 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  47.46 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  46.77 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  51.61 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  51.61 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  51.61 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  45.31 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  51.61 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  51.61 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  45.31 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  50.85 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  50.85 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 
73 aa  62  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  45.31 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 
71 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 
72 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  47.46 
 
 
66 aa  62  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  43.75 
 
 
72 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  49.15 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  54.39 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
224 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  48.44 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  47.37 
 
 
78 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  43.75 
 
 
72 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 
69 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  43.75 
 
 
72 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
72 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  42.19 
 
 
72 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>