More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L54_0023 on replicon NC_007105
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  100 
 
 
87 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  98.44 
 
 
64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  90.48 
 
 
64 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  66.13 
 
 
66 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  67.74 
 
 
65 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  62.9 
 
 
64 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  59.32 
 
 
63 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  58.46 
 
 
69 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  57.38 
 
 
71 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  56.45 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  56.45 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  56.45 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  56.45 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  56.45 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  56.45 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  56.45 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  56.45 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  56.45 
 
 
67 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 
64 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  57.14 
 
 
63 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  54.84 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4938  transcriptional regulator, DNA-binding protein  57.38 
 
 
63 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4953  transcriptional regulator, DNA-binding protein  55.56 
 
 
63 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  56.9 
 
 
63 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5107  DNA-binding protein  55.74 
 
 
63 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5498  DNA-binding protein  55.74 
 
 
63 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  49.21 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  52.31 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  55 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  55 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  43.08 
 
 
377 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  45.31 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.54 
 
 
376 aa  63.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1868  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 
63 aa  64.3  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  47.69 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  46.88 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  46.88 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  46.88 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  45.31 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 
77 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  45.31 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  45.31 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  45.31 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  45.31 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  45.31 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
70 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
75 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  43.55 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
69 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 
65 aa  60.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  43.55 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  40.3 
 
 
377 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  49.21 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  47.37 
 
 
71 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  43.55 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
67 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  42.11 
 
 
377 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.54 
 
 
68 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  44.62 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  40 
 
 
68 aa  57  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  45.61 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  45.61 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  45.61 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  45.61 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  45.61 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  41.54 
 
 
70 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  45.61 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  45.61 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
73 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  43.55 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  39.68 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  39.68 
 
 
78 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  41.67 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
64 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  39.66 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>