More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0427 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  100 
 
 
66 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  63.64 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  62.12 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  60.61 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  60.61 
 
 
67 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  59.09 
 
 
67 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  57.58 
 
 
67 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  57.58 
 
 
66 aa  88.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  59.09 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  57.58 
 
 
67 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  57.58 
 
 
67 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  57.58 
 
 
67 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  60.94 
 
 
69 aa  83.6  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  60.94 
 
 
66 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 
67 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  57.81 
 
 
66 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  57.81 
 
 
66 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  59.38 
 
 
68 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  60.32 
 
 
66 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  59.38 
 
 
65 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 
77 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 
68 aa  77.4  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  58.06 
 
 
70 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  54.69 
 
 
73 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  51.52 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
69 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  50 
 
 
376 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  46.15 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  46.97 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  46.03 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  46.03 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  46.03 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  46.03 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  46.03 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  46.03 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 
63 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  46.97 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  52.46 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  52.46 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  46.03 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  49.15 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  46.55 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  45.31 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  45.31 
 
 
377 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  43.33 
 
 
72 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  44.44 
 
 
377 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  43.94 
 
 
66 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
69 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 
71 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
63 aa  60.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  40.32 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  43.55 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  43.55 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  43.55 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
64 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  43.55 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  43.55 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  43.55 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  41.27 
 
 
377 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  43.55 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 
73 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  44.26 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  43.33 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  43.55 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  49.12 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
63 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  38.71 
 
 
69 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4938  transcriptional regulator, DNA-binding protein  46.55 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
69 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  45 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5107  DNA-binding protein  47.37 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4953  transcriptional regulator, DNA-binding protein  47.37 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282305  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  43.55 
 
 
87 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  43.55 
 
 
64 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5498  DNA-binding protein  47.37 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
63 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  37.88 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  43.75 
 
 
69 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  37.88 
 
 
73 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  37.88 
 
 
73 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>