More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1032 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  100 
 
 		 69 aa  141  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  100 
 
 		 69 aa  141  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  75 
 
 		 65 aa  97.4  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4938  transcriptional regulator, DNA-binding protein  73.33 
 
 		 63 aa  93.6  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  73.33 
 
 		 63 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5107  DNA-binding protein  71.67 
 
 		 63 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4953  transcriptional regulator, DNA-binding protein  71.67 
 
 		 63 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5498  DNA-binding protein  71.67 
 
 		 63 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  66.67 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1868  XRE family transcriptional regulator  65 
 
 		 63 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 64 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  53.73 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  53.73 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  53.73 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  53.73 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  53.73 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  53.73 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  53.73 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  53.73 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  53.73 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  51.61 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 		 69 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  55 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  55 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  53.33 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  52.63 
 
 		 63 aa  67  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  50 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  52.46 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  52.54 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  52.54 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  50.85 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  50.85 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  55 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 63 aa  62  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  46.88 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  48.28 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  48.28 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  46.88 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0372  XRE family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0794944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0370  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0505  DNA-binding protein  53.45 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0377  DNA-binding protein  53.45 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00278297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  53.45 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0368  PbsX family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000574241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0365  PbsX family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  53.45 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  53.45 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  53.45 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4867  DNA-binding protein  53.45 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  46.88 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  42.65 
 
 		 376 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.62 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  40.62 
 
 		 377 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  44.78 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>