More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3339 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  100 
 
 		 68 aa  140  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  77.27 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  74.24 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  78.12 
 
 		 66 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  74.24 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  73.44 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  67.16 
 
 		 68 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  71.88 
 
 		 77 aa  98.6  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  72.58 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  67.65 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  70.97 
 
 		 66 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  69.35 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  70.97 
 
 		 66 aa  93.2  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  69.35 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  69.35 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  67.74 
 
 		 67 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  67.74 
 
 		 67 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  67.74 
 
 		 67 aa  90.5  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  67.74 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  68.25 
 
 		 69 aa  87.8  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 63 aa  85.5  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 67 aa  84.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 67 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  55.38 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  54.69 
 
 		 67 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  59.38 
 
 		 66 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  54.69 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  50 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  46.88 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  52.38 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  50.82 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  49.18 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  49.18 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  49.18 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  49.18 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  49.18 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  40.3 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  49.18 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  49.18 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  40 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1123  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  40 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  46.67 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  40 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0372  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0794944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>