More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1128 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 65 aa  134  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  75 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  75 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  70.97 
 
 		 70 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4938  transcriptional regulator, DNA-binding protein  67.74 
 
 		 63 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5107  DNA-binding protein  67.74 
 
 		 63 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1868  XRE family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 63 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4953  transcriptional regulator, DNA-binding protein  67.74 
 
 		 63 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5498  DNA-binding protein  67.74 
 
 		 63 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  66.13 
 
 		 63 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  55.17 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0505  DNA-binding protein  56.9 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0377  DNA-binding protein  56.9 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00278297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0368  PbsX family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000574241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0365  PbsX family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  56.9 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  56.9 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4867  DNA-binding protein  56.9 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  56.9 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  56.9 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  43.55 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  50.85 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0372  XRE family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0794944  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  46.03 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2164  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  48.15 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0370  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  48.28 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  39.66 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  39.66 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2913  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 432 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>