More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_489 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  100 
 
 		 67 aa  137  7e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  98.51 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  94.03 
 
 		 67 aa  130  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  59.09 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  57.58 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  57.58 
 
 		 67 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  59.09 
 
 		 67 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  57.58 
 
 		 67 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  54.69 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 67 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  57.81 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 66 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  56.06 
 
 		 67 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  56.06 
 
 		 67 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  56.06 
 
 		 67 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  56.06 
 
 		 67 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  57.81 
 
 		 72 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 72 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 69 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  51.56 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  50 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  48.44 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  48.44 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  48.44 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  48.44 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  50 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  50 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  50 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  50 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  55 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 65 aa  67  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  47.54 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  51.67 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  46.97 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  53.23 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  53.23 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  50.82 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  54.1 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  54.1 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  54.1 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  50.91 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 69 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  51.61 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  51.61 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  51.61 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 73 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  50.88 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 224 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  45 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0737  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 68 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  45.16 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>