More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0600 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
72 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  95.83 
 
 
72 aa  140  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  95.83 
 
 
72 aa  141  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  94.44 
 
 
72 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  93.06 
 
 
75 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  93.06 
 
 
72 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  91.67 
 
 
75 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  91.67 
 
 
72 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  91.67 
 
 
75 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  91.67 
 
 
75 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  91.67 
 
 
72 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  45.83 
 
 
73 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  45.83 
 
 
73 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  45.83 
 
 
73 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 
67 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 
65 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  56.25 
 
 
65 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  45.07 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  45.07 
 
 
73 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  45.07 
 
 
73 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  45.07 
 
 
73 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  45.07 
 
 
79 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  45.07 
 
 
73 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  50 
 
 
67 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  50.7 
 
 
80 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  52.86 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  54.1 
 
 
67 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  53.73 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  53.73 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  53.73 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  52.86 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  53.73 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  52.86 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  53.73 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  53.73 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  48.44 
 
 
67 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  55.93 
 
 
74 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  50.77 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  55.93 
 
 
73 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  52.31 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  44.44 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  53.97 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  50.75 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  50.75 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  46.88 
 
 
71 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  52.46 
 
 
79 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2281  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
74 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000223955  hitchhiker  0.000476001 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  55.17 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  55.17 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  53.45 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  51.47 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  48.44 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  48.44 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  48.44 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  48.44 
 
 
68 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  48.44 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  48.44 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  48.44 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  48.44 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  52.38 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  44.78 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  52.38 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  52.38 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 
72 aa  62.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  52.38 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  52.38 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  49.21 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  52.38 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  52.38 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  52.38 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  53.45 
 
 
63 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  48.61 
 
 
72 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  48.44 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
63 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  45.59 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  43.75 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4879  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 
71 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  48.39 
 
 
69 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  48.39 
 
 
77 aa  60.8  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  49.21 
 
 
66 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  49.21 
 
 
66 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  49.21 
 
 
66 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>