More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0029 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 67 aa  136  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  77.27 
 
 		 67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  77.27 
 
 		 67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 71 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  59.68 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 73 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  53.12 
 
 		 79 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  52.17 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  53.73 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  53.73 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  53.73 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  52.17 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  53.73 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  53.73 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  53.03 
 
 		 68 aa  72  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  50.72 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  46.03 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  50.79 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  53.33 
 
 		 68 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  41.54 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  41.67 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  40.62 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5148  hypothetical protein  45 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33566  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  46.97 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5112  hypothetical protein  45 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4713  transcriptional regulator  45 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0830303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4729  transcriptional regulator  45 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.693705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  46.67 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.27 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  46.97 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.27 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  39.06 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  37.88 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  50 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  38.81 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  39.68 
 
 		 377 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.67 
 
 		 368 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>