More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1655 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 81 aa  158  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  59.68 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  52.05 
 
 		 79 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  52.05 
 
 		 79 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  52.17 
 
 		 73 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  52.17 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  52.17 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  53.03 
 
 		 73 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  53.03 
 
 		 73 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  53.03 
 
 		 73 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  53.03 
 
 		 73 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 71 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  53.23 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 63 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  48.44 
 
 		 72 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  48.44 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  51.67 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  46.88 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  46.88 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  48.44 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  46.88 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  46.27 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  46.27 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  45.31 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  46.88 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  44.29 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  46.88 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  46.88 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3707  molybdate metabolism transcriptional regulator  48.53 
 
 		 374 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  48.53 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  48.53 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  48.53 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  50 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4304  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  47.37 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2467  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0430  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  49.18 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  49.23 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  43.75 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  48.21 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  44.44 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 68 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2151  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.194811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7158  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776523  normal  0.018417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  45.9 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  45.9 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  42.42 
 
 		 376 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>