More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4304 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4304  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 80 aa  160  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3164  helix-turn-helix domain-containing protein  80.82 
 
 		 83 aa  124  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0142  transcriptional regulator, XRE family  72.37 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0927186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7158  transcriptional regulator, XRE family  76.71 
 
 		 78 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776523  normal  0.018417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3389  XRE family transcriptional regulator  79.45 
 
 		 83 aa  120  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14531  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  75 
 
 		 80 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  72.22 
 
 		 90 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2467  transcriptional regulator, XRE family  60.56 
 
 		 109 aa  97.4  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  59.15 
 
 		 80 aa  88.6  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4879  XRE family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  59.42 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1855  XRE family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1276  helix-turn-helix domain protein  50.7 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  45.9 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  42.25 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  42.25 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 73 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 73 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2992  hypothetical protein  51.92 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.169879  hitchhiker  0.00733208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  50 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  47.62 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  43.55 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  45 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  40.85 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  40.85 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  40.85 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  52.83 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  48.33 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  40 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 72 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0430  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  46.55 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0094  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  45 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  42.62 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  43.55 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  42.62 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>