211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1276 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1276  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4879  XRE family transcriptional regulator  74.71 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1855  XRE family transcriptional regulator  73.56 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0534  transcriptional regulator, XRE family  67.44 
 
 		 86 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000443779  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2467  transcriptional regulator, XRE family  54.55 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  56.92 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0142  transcriptional regulator, XRE family  56.92 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0927186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3389  XRE family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14531  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3164  helix-turn-helix domain-containing protein  56.92 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7158  transcriptional regulator, XRE family  51.39 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776523  normal  0.018417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  53.62 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4304  transcriptional regulator, XRE family  50.7 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  34.72 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  46.55 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  34.72 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  43.94 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  48.33 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  41.38 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1425  transciptional regulator  42.19 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.132768  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  40.91 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  40.91 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  40.91 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0430  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  41.27 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0737  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  35.94 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 64 aa  50.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  41.38 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 224 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2281  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000223955  hitchhiker  0.000476001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 72 aa  48.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1932  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000103733  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 73 aa  48.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>