More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3012 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  100 
 
 
69 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  100 
 
 
69 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  100 
 
 
69 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  91.3 
 
 
69 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  91.3 
 
 
69 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  90.91 
 
 
66 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  90.91 
 
 
66 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  90.91 
 
 
66 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  72.73 
 
 
66 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5148  hypothetical protein  58.73 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4713  transcriptional regulator  58.73 
 
 
75 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0830303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4729  transcriptional regulator  58.73 
 
 
75 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.693705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5112  hypothetical protein  58.73 
 
 
75 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 
77 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  52.46 
 
 
78 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  52.46 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  52.31 
 
 
68 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 
66 aa  71.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
69 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  52.46 
 
 
71 aa  69.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  52.46 
 
 
67 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  56.36 
 
 
79 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
64 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 
71 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 
71 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 
68 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  53.23 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  50 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  50 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  49.23 
 
 
67 aa  67.8  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  51.61 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  51.61 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  51.61 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  51.61 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  51.61 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  51.61 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  51.61 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 
64 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
63 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 
69 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  51.61 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7158  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 
78 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776523  normal  0.018417 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  48.53 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  48.33 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  45.31 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2052  XRE family transcriptional regulator  50.79 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.14736  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  53.85 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  50 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  53.23 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  41.54 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
63 aa  63.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  53.45 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  53.45 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  53.45 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  53.45 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  53.45 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  53.45 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  53.45 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  53.45 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  55.56 
 
 
62 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  53.45 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 
63 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  51.61 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  48.28 
 
 
72 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  46.15 
 
 
71 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  53.45 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  60.42 
 
 
73 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  48.39 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  41.54 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3164  helix-turn-helix domain-containing protein  47.54 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0375363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 
73 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3389  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14531  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  51.72 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1932  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000103733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
63 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  51.72 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0094  transcriptional regulator, XRE family  53.85 
 
 
70 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2281  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
74 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000223955  hitchhiker  0.000476001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  52.46 
 
 
77 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  48.44 
 
 
68 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2992  hypothetical protein  53.85 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.169879  hitchhiker  0.00733208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0533  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 
90 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>