More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0591 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 68 aa  140  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  82.35 
 
 		 68 aa  117  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  73.13 
 
 		 83 aa  97.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  48.39 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 68 aa  62  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  43.33 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  42.19 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  43.55 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  40.32 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  45.16 
 
 		 377 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  45.16 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1115  transcriptional regulator, Cro/CI family  39.06 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.253142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4713  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0830303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4729  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.693705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5112  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5148  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  43.33 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3723  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  41.94 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  40.32 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  43.55 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0149  molybdate-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 349 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0290887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  45 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0094  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1868  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>