More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0246 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 69 aa  143  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  77.61 
 
 		 77 aa  110  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  70.97 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  68.18 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 66 aa  97.1  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  67.74 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  70.31 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  67.65 
 
 		 68 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  67.74 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  68.75 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 68 aa  94.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 65 aa  94  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  63.08 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  67.19 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  67.19 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  67.19 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  67.19 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 67 aa  90.5  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 66 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 67 aa  84  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  60.94 
 
 		 66 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  59.38 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  57.81 
 
 		 67 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1579  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 67 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  46.97 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  46.97 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  46.97 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  46.97 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  46.97 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  46.97 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  46.97 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  53.97 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 69 aa  70.1  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  46.27 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  47.69 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  50 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  44.62 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  50.77 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  50.77 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  50.77 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  50.77 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  50.77 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  39.71 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  43.94 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  48.33 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  47.37 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0363  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  46.15 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  46.15 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  43.33 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  45.16 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  48.33 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>