More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05270  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 68 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0591  transcriptional regulator, XRE family  82.35 
 
 		 68 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2664  transcriptional regulator, XRE family  79.1 
 
 		 83 aa  106  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.406995 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  45 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  46.77 
 
 		 377 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 67 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 64 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  48.39 
 
 		 64 aa  60.1  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  47.54 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  46.77 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  41.94 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0686  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000669096  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  48.28 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4713  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0830303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4729  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.693705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5112  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  43.55 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5148  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.33566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  43.55 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0717  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0737  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  44.07 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.94 
 
 		 377 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3012  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.632687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2934  helix-turn-helix family DNA-binding protein  40.32 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3243  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  43.33 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>