More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1868 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1868  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 63 aa  131  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  75.41 
 
 		 63 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5107  DNA-binding protein  75.41 
 
 		 63 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4953  transcriptional regulator, DNA-binding protein  75.41 
 
 		 63 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5498  DNA-binding protein  75.41 
 
 		 63 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  73.77 
 
 		 70 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4938  transcriptional regulator, DNA-binding protein  73.77 
 
 		 63 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 65 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  65 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  65 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  50 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  50 
 
 		 67 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  53.45 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  46.77 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  47.54 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  46.77 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2365  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.729391 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0430  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  46.88 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 71 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  43.55 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2151  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.194811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  51.72 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0370  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  49.15 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12593  repressor protein  43.1 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3037  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  43.1 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0408  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4867  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0377  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00278297  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0368  PbsX family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000574241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.38 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0365  PbsX family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  41.38 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.98 
 
 		 376 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 71 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>