More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0020 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  100 
 
 		 70 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4938  transcriptional regulator, DNA-binding protein  71.43 
 
 		 63 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4953  transcriptional regulator, DNA-binding protein  73.02 
 
 		 63 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5107  DNA-binding protein  71.43 
 
 		 63 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5575  DNA-binding protein  71.43 
 
 		 63 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5498  DNA-binding protein  71.43 
 
 		 63 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1868  XRE family transcriptional regulator  73.77 
 
 		 63 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  70.97 
 
 		 65 aa  97.4  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1032  DNA-binding protein  66.67 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0899  transcriptional regulator  66.67 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0252882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  52.38 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  52.38 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  52.38 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  50.82 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0957  hypothetical protein  49.21 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  53.45 
 
 		 63 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 68 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2164  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.27184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0430  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  46.55 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  46.55 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  51.72 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2913  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  53.45 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0505  DNA-binding protein  50 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4867  DNA-binding protein  50 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0377  DNA-binding protein  50 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00278297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0457  DNA-binding protein  50 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0368  PbsX family transcriptional regulator  50 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000574241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0365  PbsX family transcriptional regulator  50 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0505  DNA-binding protein  50 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0372  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0794944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0435  DNA-binding protein  50 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0391  DNA-binding protein  50 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  45.16 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2496  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000294217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  45 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0370  transcriptional regulator  50 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 70 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  44.07 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  41.54 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2263  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.784233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2992  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.169879  hitchhiker  0.00733208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2523  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2539  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10177e-42 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2347  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203994  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2306  DNA-binding protein  44.83 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129797  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  46.55 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>