140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3044 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  100 
 
 		 264 aa  540  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  37.59 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  32.75 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  30.4 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  23.67 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  30.69 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  27.38 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  27.78 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  28.52 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  26.02 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  33.78 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  28.38 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  26.25 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  31.75 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  27.65 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  29.58 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  31.29 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  30.99 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  26.42 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0972  transcriptional regulator, XRE family  35.35 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  28.37 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  30.87 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  38.74 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0925  hypothetical protein  46.43 
 
 		 66 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  36.61 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  26.61 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0508  DNA-binding protein  23.93 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0116829  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  34.44 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  47.54 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  31.72 
 
 		 213 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  31.54 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  36.89 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  27.04 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  26.41 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  27.35 
 
 		 209 aa  52.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  26.14 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 		 119 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  36.45 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  32.74 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  25.83 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 113 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  25.91 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  31.58 
 
 		 229 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  34.62 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  22.94 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  46.55 
 
 		 383 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  29.73 
 
 		 216 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  26.29 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2394  Cro/CI family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  50 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  30.3 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  32.99 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  34.78 
 
 		 144 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  32.62 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  25.73 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  25.42 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  31.33 
 
 		 331 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  33.93 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  39.34 
 
 		 509 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2836  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  30.89 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0838943  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  23.53 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  36 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1284  XRE family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 127 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  26.56 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  26.12 
 
 		 302 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  25.9 
 
 		 216 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 352 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  36 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  30.86 
 
 		 348 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  30.86 
 
 		 347 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  24.14 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 513 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 117 aa  45.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 128 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  37.5 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 512 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  26.92 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  30.4 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 67 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  30.12 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  40.35 
 
 		 60 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  31.82 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 111 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  33.9 
 
 		 103 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3951  helix-turn-helix domain protein  41.82 
 
 		 113 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  28.37 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  27.15 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  32.94 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>