110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3262 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  55.74 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  54.32 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  56.74 
 
 		 218 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  43.29 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  40.83 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  40.83 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  39.5 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  38.49 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  39.67 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  40.76 
 
 		 229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  39.51 
 
 		 240 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  40.66 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  40 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  38.84 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  38.22 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  35.68 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  37.78 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  39.76 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  39.52 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  38.62 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  34.54 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  35.98 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  34.9 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  29.34 
 
 		 270 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  28.16 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  27.92 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  27.92 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  28.22 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  26.78 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  26.36 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  26.69 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  27.2 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.85 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  24.05 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  24.79 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  28.33 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  27.78 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  24.9 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  25 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  27.67 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  25.61 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  27.78 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  22.13 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  27.43 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  25.21 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  29.59 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  31.01 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  24.17 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  31.01 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  26.86 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  39.71 
 
 		 71 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  24.77 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  22.54 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  33.77 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  27.18 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  22.27 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  25.1 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  24.03 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  25.12 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  35.48 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  38.71 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  27.43 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  26.64 
 
 		 204 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  37.5 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  42.03 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  25.11 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  29.17 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  31.34 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  23.21 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  32.37 
 
 		 193 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  23.05 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  32.85 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  34.12 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  23.72 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  23.72 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  39.66 
 
 		 117 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  25.32 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  26.67 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  23.36 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  24.34 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  31.33 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  29.2 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  29.55 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  27.27 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  28.57 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  25.47 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  23.02 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  22.67 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  23.76 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  35.94 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  23.61 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1543  helix-turn-helix domain-containing protein  25.53 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>