133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1024 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  100 
 
 		 265 aa  521  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  32.4 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  28.21 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  27.87 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  32.18 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  29.03 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  32.62 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  25.32 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  35.37 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  26.4 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  25.13 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.12 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  32.16 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  25 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  37.04 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  31.78 
 
 		 819 aa  62  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  26.61 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  26.2 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  40 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  42.03 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  40.51 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  28.28 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  34.04 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  33.82 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  36 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  33.93 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  37.35 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  32.54 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  45.24 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  27.19 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  23.98 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  28.09 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  30 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  39.08 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  41.3 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  32.62 
 
 		 143 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  28.18 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  25.91 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  38.1 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  35.14 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  36.62 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  22.18 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  22.18 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  35.09 
 
 		 222 aa  52.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  27.47 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  21.1 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  40 
 
 		 143 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2378  bacteriophage CI repressor  41.67 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00068987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  24.35 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  26.25 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  26.72 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  35.8 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  33.67 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  32.84 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  24.53 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  30.83 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2385  putative phage repressor  33.75 
 
 		 130 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  26.73 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1669  helix-turn-helix domain protein  44.74 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  30.46 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  26.27 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  26.27 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  27.21 
 
 		 209 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  32.04 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  32.18 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  30 
 
 		 153 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  34.88 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  33.98 
 
 		 143 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  38.27 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  34.62 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  30.58 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  29.52 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  33.93 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  23.87 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  25.11 
 
 		 243 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  24.22 
 
 		 213 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  27.65 
 
 		 240 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  35.16 
 
 		 233 aa  45.4  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  24.07 
 
 		 244 aa  45.4  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  33.65 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  23.66 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  27.19 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.46 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  28.4 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3718  LexA repressor  31.09 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.875348  normal  0.435562 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1440  signal peptidase I, putative  24.03 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2949  DNA-binding protein, putative  24.49 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  31.43 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  32.95 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  32.97 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>