83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1268 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  100 
 
 		 230 aa  472  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  49.13 
 
 		 229 aa  224  8e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  29.74 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  29.74 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  27.71 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  30.8 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  26.84 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  25.11 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  27.39 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  23.64 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  27.04 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  27.66 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  27.04 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0548  prophage LambdaSa1, repressor protein, putative  30.18 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000127482  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  26.61 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  26.18 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  26.38 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  35.45 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  25.96 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  22.52 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  25.98 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  24.9 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  25.22 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  23.21 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.03 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  34 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  34 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  45.28 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  29.27 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  25.15 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  25.11 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 474 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  35.59 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  28.23 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  23.87 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 186 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  30.77 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  32.81 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 272 aa  45.4  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  44.68 
 
 		 135 aa  45.4  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  31.25 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  41.18 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 99 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 85 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  33.82 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  23.02 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  25.37 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  28.21 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  23.33 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  28.24 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  25.71 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  27.88 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 142 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 134 aa  43.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2806  putative transcriptional regulatory protein  36.21 
 
 		 131 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 115 aa  43.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 115 aa  43.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  35 
 
 		 143 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 146 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  31.11 
 
 		 144 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  31.65 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3578  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  24.27 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2452  hypothetical protein  32.65 
 
 		 126 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  23.11 
 
 		 292 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 273 aa  42  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 327 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 145 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  33.96 
 
 		 108 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  24.63 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  32.14 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 189 aa  42  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  26.43 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.57 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 108 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>