156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2622 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  100 
 
 		 243 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  75 
 
 		 263 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  57.69 
 
 		 229 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  58.23 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  56.78 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  56.41 
 
 		 229 aa  277  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  55.93 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  56.84 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  55.93 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  55.51 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  52.97 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  54.67 
 
 		 225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  51.49 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  51.49 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  43.27 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  41.8 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  41.91 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  41.13 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  37.25 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  43 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  35.97 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  38.62 
 
 		 241 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  54.61 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  34.58 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  33.75 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  36.44 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  32.2 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  31.76 
 
 		 205 aa  99.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  28.15 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  32.92 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  32.65 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  26.53 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  30.08 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  24.79 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.52 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  29.82 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  25.53 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  25.85 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  43.37 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  43.37 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  30.8 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.23 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  26.36 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  25.52 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  24.79 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  45.83 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  45.83 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  32.21 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  51.43 
 
 		 131 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  27.63 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  25 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  37.21 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  32.21 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  32.82 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  32.81 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  27.92 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  26.27 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  29.17 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  33.88 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  29.17 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  41.1 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  25.86 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  26.47 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  29.22 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  26.75 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  39.47 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  24.49 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  22.41 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  27.27 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  32.23 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  24.76 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  25.99 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  28.45 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  25.12 
 
 		 216 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  30.08 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  40.54 
 
 		 459 aa  52  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  30.12 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  28.11 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  24.22 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  27.06 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  26.47 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 129 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  24.68 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  25.85 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 128 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  43.28 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3926  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 127 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 118 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  27.05 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  26.29 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>